अधिकांश भाग के लिए, पेरू की नदियाँ दुनिया की सबसे बड़ी नदी - अमेज़न के बेसिन से संबंधित हैं।
जावरी नदी
झावरी दक्षिण अमेरिका के मध्य भाग में स्थित नदियों में से एक है। भौगोलिक रूप से, नदी का तल दो देशों - पेरू और ब्राजील से संबंधित है। चैनल की कुल लंबाई 1,056 किलोमीटर है। जावरी ब्राजील के उत्तर-पश्चिमी भाग से होकर गुजरती है और अमेज़ॅन की एक सही सहायक नदी है।
नदी का स्रोत पेरूवियन एंडीज (ला मोंटग्ना) की ढलानों पर है। फिर यह पहाड़ों से उतरता है और शेष धारा के लिए ब्राजील और पेरू के बीच की प्राकृतिक सीमा है।
नदी मुहाने से 500 किलोमीटर ऊपर तक नौगम्य है। जनवरी से मई तक चलने वाले बरसात के मौसम में नौगम्य खंड की लंबाई बढ़ जाती है।
गिरुआ नदी
गिरौइस अमेज़न की कई सही सहायक नदियों में से एक है। नदी की कुल लंबाई 3280 किलोमीटर है। स्रोत पेरू के एंडीज की तलहटी में स्थित ला मोंटिया (पेरू) का शहर है।
नदी अपने संगम (क्रूज़ेरो डो सुल की नगर पालिका के क्षेत्र में) से 1,823 किलोमीटर के लिए नौगम्य है। नदी बेसिन बसा हुआ है, लेकिन मुख्य रूप से नदी के मध्य मार्ग में है।
कुरराई नदी
कुराराय दक्षिण अमेरिकी नदियों में से एक है जो दो देशों - इक्वाडोर और पेरू के क्षेत्र में स्थित है। यह नापो नदी की सही सहायक नदी है। नदी का स्रोत एंडीज की पूर्वी तलहटी है।
चैनल की कुल लंबाई 800 किलोमीटर है। और यह पास्ता (इक्वाडोर प्रांत) और लोरेटो (पेरू का क्षेत्र) के क्षेत्र से होकर गुजरता है। पेरू का क्षेत्र 414 किलोमीटर लंबा है। कुरराई साल भर गहरा है, लेकिन केवल निचली पहुंच में ही नौगम्य है। नदी का तल विरल आबादी वाले क्षेत्रों से होकर गुजरता है। मुख्य रूप से भारतीय लोग - वोरानी और क्वेशुआ - नदी के किनारे रहते हैं।
माद्रे डी डिओस नदी
माद्रे डी डिओस दो देशों - पेरू और बोलीविया - के क्षेत्र से होकर गुजरता है और अमेज़ॅन बेसिन के अंतर्गत आता है। नदी तल की कुल लंबाई 640 किलोमीटर है।
नदी का स्रोत पेरू के एंडीज में है।
माद्रे डी डिओस ऊपरी अमेज़ॅन में स्थित सबसे महत्वपूर्ण जलमार्गों में से एक है। नदी के तट पर एक बड़ा बंदरगाह शहर है - प्योर्टो माल्डोनाडो। उसके बाद, नदी नौगम्य है।
आम की खेती के लिए नदी घाटी का सक्रिय रूप से उपयोग किया जाता है। इसके अलावा, यहां सोने का खनन किया जाता है, साथ ही औद्योगिक पैमाने पर लॉगिंग भी की जाती है। नदी के तट पर कई संरक्षित प्राकृतिक क्षेत्र हैं।
मंटारो नदी
नदी का तल पूरी तरह पेरू में है और इसकी लंबाई 724 किलोमीटर है। मंटारो अपूरिमाका नदी की एक शाखा है। भौगोलिक रूप से निम्नलिखित प्रांतों की भूमि से होकर गुजरता है: जूनिन; यौली; हौका; गर्भाधान; हुआंकायो।